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21小时、950个代理,Claude自主发现类CRISPR酶系统

21小时、950个代理,Claude自主发现类CRISPR酶系统

Anthropic新成立了一个生命科学研究小组和实验室,研究方向是用Claude做基础生物学。科学家只给了高层级指导,Claude就自主发现了一套新型酶系统,特性让人想起CRISPR。

发现过程大致是这样。约950个AI代理并行搜索数据库,花了21小时,消耗2.1亿个token。其中一个代理注意到,一个奇怪的逆转录酶基因旁边,有反复出现的DNA序列模式。代理们先收集了20多万个逆转录酶,挑出3500个候选系统,再缩到20个最有力的。之后生成人类可读的报告。

Anthropic给新系统起名array-associated reverse transcriptases,缩写ART。中文直译过来,就是“阵列相关逆转录酶”。它主要在噬菌体里出现——就是感染细菌的病毒。系统由三部分组成:逆转录酶、紧挨着的一个伙伴基因,外加一段长且均匀间隔的DNA重复序列阵列。

这个重复序列的排列跟CRISPR阵列相似。初步实验里,ART的阵列会表达成一系列不同的短RNA,可能用了和CRISPR类似的机制。以前的研究在巨型噬菌体里看到过逆转录酶基因。但没人注意旁边那段非编码DNA阵列,也没人注意那个功能未知的辅助蛋白。Claude是第一个注意到这一整套特征的人。

Anthropic的实验室在湾区,只做BSL-1和BSL-2两个低风险等级的实验。这里不碰能感染人类的病原体。所有实验操作都由人类科学家完成。他们试过用AI加速这部分工作。但分子生物学实验那种临时安排的工作流,目前不适合。

研究用的是Claude Science和Claude Code,这些工具对所有科学家开放。有时,Anthropic还会用自己的协调机制让多个Claude会话并行。Claude产生的假设太多,多到假设本身成了研究对象。Anthropic把学到的经验回写给Claude,教它模仿科学家的判断力。

张锋是CRISPR基因编辑的先驱,MIT和Broad研究所教授。他对预印本的评价是:“这是AI代理对生物发现做出贡献的一个令人兴奋的例子。与逆转录酶关联的RNA重复序列阵列确实有趣,值得进一步研究。”

Anthropic已经把预印本和技术报告公开。它希望跟其他科学家合作,把这套方法用到基因组学和其他领域。它还启动了生命科学验证计划(LSVP)。这个计划面向生命科学专业人士,提供Claude Mythos、Opus和Sonnet模型。生物相关工作的安全措施,比常规更宽松。

ART在噬菌体里的自然作用,报告没有给出结论。它能不能变成可编程工具,要看后续实验。预印本是公开的,外部团队现在就能开始验证。

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